長鏈非編碼RNA測序

快,準,全面。

引領分子領域研究新熱點

長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)
是一類長度超過200 nt的長鏈非編碼RNA,通過與DNA、RNA或蛋白質結合,
在表觀遺傳、轉錄及轉錄后等水平調控基因表達。
測序采用Illumina HiSeq平臺進行測序,針對有參考基因組樣本開展準確的lncRNA鑒定
和lncRNA靶基因預測,同時提供針對測序數據中mRNA的分析,
結果更全面,廣泛應用于醫學、農學研究領域。

精準,超值,無憂。

LncRNA的研究作為RNA研究的新領域,在生產、生活、健康方面具有重要意義,
可通過不同的分子生物學機制調控編碼基因的表達,在生產上對物種的改良,
在人類健康方面參與疾病相關的信號通路從而對疾病的發生發展及治療有重要作用。

科學方案設計

從材料選取,建庫測序,到數據分析,
每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

信息分析

諾禾致源lncRNA測序項目,利用六步法對lncRNA進行準確篩選,高
效預測靶基因,并完成對轉錄本中mRNA的分析,以及lncRNA和
mRNA的比較分析、共表達網絡構建。

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lncRNA分析 mRNA分析
lncRNA拼接組裝
lncRNA位點篩選
lncRNA編碼潛能分析
lncRNA描述性統計
lncRNA靶基因預測
lncRNA保守性分析
ORF長度分析及exon個數分析
表達水平分析及差異表達分析
反義轉錄本鑒定
可變剪切分析
差異基因富集分析
TSS和TTS位點統計
SNP/InDel分析
mRNA保守性分析
ORF長度分析及exon個數分析
表達水平分析及差異表達分析
差異表達lncRNA的靶基因與差異表達mRNA取交集
lncRNA-mRNA 共表達網絡構建

悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

長鏈非編碼RNA測序采用先進的HiSeq 4000測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,
實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,
以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

出色完成每一個項目環節

至2015年12月,諾禾致源已經成功對牛、鼠、兔、雞、蝴蝶、蜜蜂、線蟲、沙棘、
香蕉、棉花、小等近70多個物種進行lncRNA測序分析,
并在Nature Structural & Molecular Biology等期刊發表針對人、豬、羊等物種的lncRNA研究成果。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”,
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。